O monitoramento microbiológico de máquinas e equipamentos industriais deve ser feito devido uma série de diretivas e regulamentos internacionais e regionais que tem como objetivo proporcionar a segurança e proteger o consumidor, provendo a sociedade meios eficazes para aferir a qualidade dos produtos.
Os testes podem ajudar a avaliar a eficácia de suas práticas de limpeza e de biossegurança. Possíveis contaminações em áreas produtivas podem trazer risco ao produto, ao consumidor e prejuízos a empresa.